Berlatar belakang di tahun 1930, Menceritakan kehidupan para mafia dan melibatkan para Alkemis dan juga “Immortal” ilmuwan-ilmuwan yang tak bisa mati.

Berfokus pada duet duo pencuri yaitu Isaac Dian dan Miria Harvent yang merupakan pencuri energic dan sangat optimistic.

Hingga saat ini ada beberapa masalah yang membuat mereka berseteru dengan para Mafia lainnya

Dimensi X, Y, dan Z telah manusia temukan sebelumnya, kini terdapat dimensi ke-4 yang baru ditemukan oleh manusia dan kemudian dinamakan dengan Dimensi W.

Kini manusia dapat menyelesaikan semua permasalahan energi  dengan cross-dimensional electric-field inductors-“coils”. Didalam dimensi tersebut manusia bahkan bisa mendapatkan energi yang tak terbatas dengan bantuan alat yaitu “Coil”.

Karena hanya New Tesla Energy selaku perusahaan yang menguasai semua penggunaan Coil, karena itu banyak sekarang beredar coil-coil ilegal sayangnya polisi tak dapat berbuat banyak. Oleh karena itu Mabuchi Kyouma, seorang Kaishuuya yang pekerjaannya hanya mengumpulkan coil ilegal demi mendapatkan imbalan dari New Tesla Energy ditugaskan untuk mengatasi mereka.

Dalam menjalankan tugasnya Kyouma sekarang dibantu oleh teman androidnya yang bertenaga Coil yaitu Mira.

Akiyuki Takehara tinggal disebuah Pulau bernama Sentain bersama ibunya, sedangkan ayahnya yang seorang dokter pergi ke suatu tempat. Pulau Sentan sendiri berada di area Free Zone, yaitu daerah yang berada di zona bebas perang yang terletak diantara dreamlike dan dipisahkan oleh Pemerintah Utara dengan bagian Selatan, serta dikelilingi oleh laut Yuden.

Hari-hari yang ia lewati seperti biasanya, namun kini hal yang luar biasa terjadi menimpa dirinya dan mengubah hidpunya. Berawal saat setelah mengantarkan bekal kepada Ryuzo yang dibuat oleh ibunya dan akhirnya pergi ke sekolah seperti biasa.

Terjadi ledakan yang sangat dahsyat menimpanya bersama dengan temannya yaitu Haru dan Furuichi. Ledakan yang misterius tanpa diketahui asalnya dan menghasilkan sebuah cahaya misterius yang merasuki tangannya, sakit yang luar biasa membuatnya tak dapat berfikir, hingga datang seorang gadis berambut putih menghampirinya dan menuntunnya untuk mendapatkan kekuatan yang luar biasa.

Dari sinilah cerita mereka dimulai

April 1889, Earl Ciel Phantomhive bersama dengan pelayannya yaitu Sebastian Michaelis dan Snake, mereka berlayar menggunakan kapal mewah Campania bertujuan untuk menyelidiki eksperimen-eksperimen ilegal pada manusia yang kemudian diperlihatkan saat pertemuan Aurora Society. Tak lama setelah itu, hal yang diluar dugaan. Orang-orang yang sebelumnya seharusnya sudah mati, namun tiba-tiba hidup kembali dan menyerang mereka.

Kabar mengenai eksperimen dan kejadian membangkitkan manusia yang telah mati menjadi pusat perhatian utama bagi Earl Ciel Phantomhive, setelah kabar tersebut beredar ditelinga masyarakat. Sesaat sebelum kabar yang belum pasti itu sampai ke diketahui oleh Ciel, dia dan pelayan terbaiknya tersebut, yaitu Sebastian, ia pun memesan sebuah kapal mewah untuk menyelidiki kasus yang ajaib ini dan juga “Asosiasi Aurora” yang telah diduga melakukan eksperimen tentang menghidupkan kembali orang yang telah mati tersebut.

Disaat Ombak laut menghancurkan kapal mereka, sekelompok makhluk misterius datang berkumpul dan mereka mengatasnamakan “Phoenix”. Padahal Ciel dan Sebastian mungkin saja hampir melangkah mendekati kebenarannya, tapi apa mereka mungkin telah ditakdirkan untuk menyelidiki sesuatu yang bisa saja berubah menjadi sebuah peti yang mengambang…?